No novo filme somos apresentados a Apocalipse, o mutante mais poderoso do universo de X-Men, que torna-se imortal e invencível depois de acumular poderes de diversos outros mutantes.
Apocalipse desperta milhares de anos depois, e não se sente satisfeito com o mundo onde acordou e resolve reunir uma equipe com mutantes poderosos, para reciclar a humanidade e fazer nascer uma nova, onde ele reinará.

Quando percebem que a terra não esta nos seus melhores dias, Raven e Professor Xavier devem formar uma equipe com jovens X-men's e tentar parar o seu pior inimigo, e salvar a humanidade da sua destruição total.